结核病是危害人类健康的主要传染病之一，是当今世界上传染病中的主要杀手，我国结核病疫情日趋严重，防控形势非常严峻。目前用于预防结核病的卡介苗对成年人的肺结核几乎没有保护力，近年来全球正在研发疫苗，如结核减毒活疫苗、BCG重组疫苗、结核亚单位疫苗以及DNA疫苗等临床试验效果均不理想。目前，母牛分枝杆菌（Mycobacterium vaccae）疫苗是近90年来针对结核病仅有的一个进入III期临床试验的免疫治疗性疫苗，其商品名称为微卡。尽管其应用前景非常看好，但是关于此疫苗株的基因组、蛋白质组、免疫抗原组份等背景都不清楚。

金奇课题组的郑建华副研究员等采用第二代深度测序（next-generation sequencing (NGS) technologies）结合第三代测序技术, 对微卡的全基因组序列进行了测定，同时利用凝胶电泳结合高分辨率、高精确性的傅里叶转换质谱，对微卡的蛋白质组进行了系统、全面的分析，鉴定出3387个可信度极高的蛋白，其中581个基因组中编码的“hypothetical proteins” 在蛋白水平得到了验证。同时确认了445个蛋白的翻译起始位点，更正了98个蛋白的起始位点。更有意思的是，首次发现了38个在基因组注释中漏掉的“新”蛋白。结合蛋白质组和基因组测序结果，采用蛋白组基因组学方法，首次获得微卡的基因组精细图谱和准确的注释。

随后采用免疫蛋白质组学方法，利用活动性肺结核病人的血清样本，初步筛选并鉴定出35个免疫抗原候选物，将其中的20个编码基因进行克隆和表达，纯化后的蛋白与100个结核病人的血清样本进行体液免疫验证，其中的8个能产生较强的阳性免疫反应。进一步进行细胞免疫分析后发现，其中的一个蛋白，MYVA_1927，也具有较强的细胞免疫活性。这是首次从体液免疫和细胞免疫水平鉴定出微卡的多个免疫原，有利于进一步深入地阐明微卡刺激宿主产生免疫保护的机制，为研究具有我国自主知识产权的疫苗提供了理论基础和科学依据。

文章题目：Proteogenomic analysis and discovery of immune antigens in Mycobacterium vaccae.