细菌细胞外可收缩注射系统（extracellular Contractile Injection System, eCIS）是一种与噬菌体的可收缩尾部有着高度相似性的转运系统。前期研究仅在沙雷氏菌、发光杆菌和藤黄紫假交替单胞菌三种革兰氏阴性菌中被实验鉴定。我所江峰博士等于今年4月在《Cell》杂志报道了首个完整的eCIS装置（发光杆菌PVC系统）的精细结构，进一步揭示了这类转运系统的作用机理和重要意义。

在此基础上，杨剑课题组与北京友谊医院及英国华威大学的研究人员合作，依据当前已经证实的三套eCIS系统的数据信息，通过基于隐马模型的蛋白特征谱结合基因组排列关联性分析，从源自公共数据库的11,699株完整细菌基因组中成功鉴别出631个可能编码eCIS的基因簇，并构建了专用数据平台。研究结果表明，eCIS广泛分布于革兰氏阴性菌、阳性菌和古细菌中，并依据其排列方式和进化关系可以被划分为两个谱系（包括六种亚型）。而前期研究鉴定出的三套eCIS系统均属于其中的一个谱系内的两种亚型。有意思的是，现有完整细菌基因组中的eCIS和六型分泌系统（T6SS）的分布情况表明，这两类系统极少同时存在于同一株细菌基因组中，暗示eCIS和T6SS之间可能存在关联。更进一步对来自EnteroBase数据库的178,998株全基因组测序（WGS）草图数据的系统分析还发现了143株可能携带eCIS系统的肠道沙门氏菌。该项研究为进一步深入探索eCIS系统对细菌与宿主及环境的相互作用的影响提供了重要数据基础和分析平台。