随着高通量DNA测序技术的飞速发展，越来越多的物种完成了基因组测序。现阶段基因组的注释主要依靠生物信息学分析完成基因组蛋白编码区等的预测，其错误率较高，缺乏实验证据。近年来，蛋白组基因组学（proteogenomic）的逐渐兴起，蛋白组基因组学并结合表达组学能够从基因组编码蛋白和转录组层面对生物信息学的分析结果进行验证、完善，显著提高了基因组注释的准确性。
   红色毛癣菌是重要的浅表感染真菌，也是人类病原丝状真菌研究重要的模式生物。红色毛癣菌的基因组测序和注释于2010年由Broad Institute 完成。金奇课题组应用串联质谱技术对红色毛癣菌的全蛋白质组进行分析并结合该真菌在不同生长时相的转录组学实验数据对基因组原有注释进行了验证和完善，共确证了4,291个基因的表达产物，修正了161个注释错误的基因编码区并发现了9个以前未注释的新基因。这些结果为今后基因组数据在红色毛癣菌及其他高同源浅表感染真菌遗传特点和致病性研究中的利用打下了基础。该研究采用的方法整合了蛋白质组学、转录组学实验数据，在转录水平和表达水平进行相互验证，结果互相补充，这一方法对其他基因组的精确注释有借鉴意义。