2003年，重症急性呼吸综合征冠状病毒（Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus，SARS-CoV）在我国出现并引起全球多个国家和地区的暴发流行，全球报道超过八千例感染病例，774人死亡。在过去的十几年里，围绕着这个病毒从何而来，是通过何种渠道感染人类这两个问题，国内外的病毒学家做了大量的研究工作。我国和国外研究者合作从分布于我国南方的中华菊头蝠体内鉴定得到了多株类SARS冠状病毒（SARS Like-CoV，SL-CoV），其基因组与人SARS-CoV有较高的（最高可达95%）同源性，故而推测人SARS-CoV很可能起源于中华菊头蝠携带的蝙蝠冠状病毒。但在对以往分离的大量蝙蝠ß冠状病毒的研究发现，虽然SL-CoV与SARS-CoV的大部分基因序列同源性较高，但依然存在两个gaps，即两种冠状病毒基因组中的Spike （S）和ORF8存在极大的差异。其中ORF8编码区序列是迄今为止所发现的各种物种冠状病毒中唯有蝙蝠冠状ß病毒所特有的。特别是该ORF编码区在SARS病毒初期感染者分离株中是完整的，但是在SARS病毒中、后期感染者分离株中全部发生了缺失变异。因此ORF8成为确定SARS-CoV在蝙蝠中的起源重要标志之一。

金奇课题组通过对本课题组前期覆盖我国40个蝠种和部分果子狸的病毒组数据（Wu ZQ et al, ISME J.2016）的深入分析，首次系统性地对我国蝙蝠所携带ß冠状病毒的基因组结构进行研究，以期获得SARS病毒溯源的新线索。研究结果显示：各种蝙蝠所携带的SL-CoV的ORF8编码区域序列差异较大，可分为三种类型。分布于我国南方地区极个别中华菊头蝠所携带的SL-CoV不仅在基因骨架序列与SARS病毒达到96%的同源，而且其ORF8编码区序列与SARS-CoV初期感染者中分离到的SARS毒株序列同源性为99%。上述结果为SARS-CoV在蝙蝠中的溯源提供了新的强有力的证据。同时，相对于其他蝠种，中华菊头蝠所携带的SL-CoV的S基因的序列表现出极大的多样性，这也为SL-CoV在中华菊头蝠中通过频繁重组获得与人SARS-CoV相同的S基因进而获得感染人的能力提供了基础。此外，针对国内多个地区野生和养殖果子狸的病毒组分析没有发现该物种中存在任何种类的冠状病毒，进一步提示果子狸并不是SARS-CoV的自然宿主。这些研究发现为SARS-CoV的溯源提供了新的证据与线索。