2023年7月6日，我所吴志强、金奇和钱朝晖研究团队联合在National Science Review杂志发表了题为“A comprehensive survey of bat sarbecoviruses across China in relation to the origins of SARS-CoV and SARS-CoV-2”的研究论文。

自新冠疫情暴发以来，虽然有研究提示SARS-CoV和SARS-CoV-2等Sarbecovirus亚属冠状病毒可能的自然宿主为蝙蝠，但有关SARS-CoV-2的真正动物起源一直未有明确的答案。为进一步回答这一科学问题，研究团队通过对南方14省703个栖息地54个蝠种13,064份样本开展多组学扫描，在获得了146株Sarbecovirus亚属冠状病毒的基因组序列的基础上，对中国境内蝙蝠携带Sarbecovirus亚属冠状病毒的遗传多样性、宿主特征、进化变异及重组规律等做了全面系统分析。该研究发现，中国境内菊头蝠携带的Sarbecovirus亚属冠状病毒呈现由西南地区向东部和北部地区分化的趋势，虽然多地区的菊头蝠种群中存在SARS-CoV相关病毒的流行，但这些病毒均非SARS-CoV的直接祖先，而中国境内的菊头蝠中并不存在SARS-CoV-2相关病毒的活跃流行。该研究同时发现，中国境内极少量的菲菊头蝠可携带一类Sarbecovirus亚属的重组病毒，这类重组病毒代表一个独立的进化分支，并随着菲菊头蝠种群的逐步扩散，向东北方向分化。

 图. Sarbecovirus亚属冠状病毒系统发生分析图

研究团队综合现有的发现，认为有必要在西南边境线、中南半岛乃至全球更广阔的地区开展深入研究，来探索与SARS-CoV和SARS-CoV-2关联性更高的动物冠状病毒的多样性。同时，应该进一步加强蝙蝠携带重组冠状病毒的监测，来预警未来新发传染病的发生。

该研究获得了国家重点研发计划（2021YFC2300902）、中国医学科学院医学与健康科技创新工程（2021-I2M-1-038和2020-12M-CoV19-010） 、北京市自然科学基金（M21002） 、中央级公益性科研院所基本科研业务费（2019PT310029）等项目的支持。我所吴志强研究员、金奇教授、钱朝晖研究员和沈阳农业大学张树义教授为本文的共同通讯作者，吴志强研究员、博士研究生韩业林、博士研究生王宇洋、刘博主管技师和硕士研究生赵腊梅为本文的共同第一作者。