毒力因子是病原菌所编码的能够促使其在宿主环境中定植、繁殖和致病的基因产物的统称。病原菌毒力因子数据库（简称VFDB，http://www.mgc.ac.cn/VFs/）由我所杨剑课题组建立并长期维护，经过十多年的持续升级和更新已经发展成为国际上最大的病原菌毒力因子数据资源中心，被国内外同行广泛使用。

近年来基于宏基因组技术的微生物组研究逐步成为微生物学的前沿热点之一，而微生物组大数据包含了大量来自不同种属细菌的基因组数据。由于传统的细菌学家通常只专注于一种或几种相关种属的细菌的致病机制研究，当前VFDB数据库中来自不同种属的细菌毒力因子的命名和分类虽然存在一定关联性，但缺乏统一的标准，因而难以应用于微生物组等跨种属的数据挖掘。为此，杨剑课题组的刘博和郑丹丹等在前期工作基础上，基于文献信息挖掘和数据整合分析，在VFDB数据库平台上首次建立了病原菌毒力因子通用分类体系VFcategory。该分类系统目前包含14个基础分类，并可以进一步细分为100多个子类，从而涵盖VFDB数据库中收录的32个属百余种重要人类致病菌的所有已知毒力因子。同时，还设计开发了更加简洁易用的数据库平台界面，方便全球用户访问和使用。

该研究建立的病原菌毒力因子通用分类体系，不仅为针对微生物组大数据的毒力因子分析开辟了道路，而且为进一步开展跨种属的毒力因子数据挖掘奠定了基础。近日，相关研究成果发表于《Nucleic Acids Research》杂志，我所刘博和郑丹丹两位博士为论文共同第一作者，杨剑研究员和陈立宏副研究员为论文共同通讯作者。该研究获得了国家自然科学基金和中国医学科学院医学与健康科技创新工程等项目资助。